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动物研究表明，胰腺外分泌功能不全（pei），可诱导肠道细菌过度生长和生态失调，其中乳杆菌和双歧杆菌的丰度增加最多，这种情况可通过胰酶替代治疗部分逆转。临床研究也证实pei与肠道菌群失调之间存在密切关联。胰腺外分泌功能，十二指肠ph值的改变，以及pei引起的胆盐吸收不良可能影响和塑造肠道菌群的丰度和组成。反过来，肠道微生物群可能通过潜在的反作用影响胰腺外分泌部的功能。